寛永４年４月、北海道に向かう筑紫国の弁天丸が日本海航海途中に遭難となり、寿都湾で座礁した際、船主乗組員は神の守護と住民に救助された事に感謝し、船中の弁天神を岩崎町の一角に祠を建て奉斎した。後にこの近辺が松前藩士鈴木喜三郎の知行する漁場となり、戸数増加の形態を為すにより厚い信仰を受け、新たに社を建立した。明治５年８月、厳島神社と称して郷社に列格、大正１４年１１月、「壽都」の町名を冠し、壽都神社と改称した。昭和５２年１１月、国道２２９線の境内地通過に伴い現在地に遷座、平成２０年には御創祀３８０年を迎え、記念大祭・神輿全面修復・社務所改築工事が記念事業として行われた。また、時代毎に船主が奉納した一の鳥居・錨・北前船絵馬が大切に保存されている。御創祀３８０年の歴史と古格は、後志一を誇る我が故郷の文化遺産である。